Мне очень жаль ваши деньги и сочуствую вам в вашей ситуации.
Я пытаюсь донести вам одно, когда взламывают "биржу" не кто не трогает пользователей, можете почитать об этом на примерах всех публичных взломов бирж, обменников и т.д. Так что если бы случилось то что вы предполагает вы как минимум увидели бы сайт биржи оффлайн минимум 3-5 часов. И украли бы горячие пурсы как минимум.
взломав их протокол или изнутри
Они используют протоколы HTTP/HTTPS/Bitcoin/SMTP и др. более низкие. При нахождение в них уязвимости не кто бы не позарился на ваши 40к.
они обязаны провести расследование и вернуть деньги!
Идете в полицию открываете дело, если вам повезет и дело дойдет до запроса, я думаю btc-e может поднять логи стакана и сообщить по каким аккаунтам разошолся ваш ордер. Далее вы получите почту и IP входа этих аккаунтов (При официальном запросе полиции). Далее они должны вычислить и задержать злоумышленика, далее суд, возврат ваших денег. Сама биржа вам нечего возмещать не будет.
По моему опыту, могу вам сказать, скорей всего это был троян/кейлогер, либо кто то локально украл ваши данные, логин пароль или апи ключ. Скажу более: 50% что вы знаете этого человека лично. 90% что он был в курсе что вы торгуете и вожможно вы упоминали где то что у вас там не 1000 руб.
Мой совет забыть, и начать более внимательно относиться к своей безопастности
хех... пора меня в сапорт btc-e брать

Дело в том что keylogger это лишь ваше предположение! А факт в том что у меня на мас нету не логгеров не троянов! Я проверил! И если они не вернут мне 40 К то я сделаю все и напишу в серьезные издания чтобы все узнали! Чтобы осадочек как говориться остался! А даже если меня хакнули! То их знания о безопасности в этой области по сравнению с моими как у образованного взрослого по сравнению с ребенком! Никто не может в этом мире знать всего! И если их они мне настоятельно не рекомендовали или вообще не сделали это обязательным условием то значит они неправильные пчелы и пусть все об этом знают! Да и еще когда я в тот же день обратился к ним с информацией что меня хакнули они не предприняли ровным счетом ничего, а вот сейчас же поставили холд на всей бирже на вывод битков с чего бы это? Могли это и тогда сделать когда я написал об этом! и тогда может и можно было спасти деньги!