La diferencia de precio de Btc-e coincide exáctamente con el premium que cuesta meter $ en dicho exchange. Es decir si está un 5% más barato es porque enviar el dinero para comprar te cuesta un 5% más que en otro exchange.

Existen bots comerciales para hacer arbitraje y ni por esas me parece lo suficientemente atractivo a menos que tengas una capital considerable y mucha paciencia. Será rentable para gente que se dedica a ello a lo bestia imagino, arbitrando en multitud de exchanges y con soluciones automatizadas.