"появился третий, но через несколько минут исчез"
В GUI кошелька 0.6.26 есть баг в отображении вкладки Harvested blocks: найденные блоки правильно отображаются, только если туда заходим, переключившись с вкладки Dashboard текущего аккаунта. Иначе отображается микс найденных блоков из текущего и предыдущего аккаунта, который перед этим наблюдался, или что-то в этом роде. В общем, детали бага для нас неважны, важно его наличие, из чего следует, что в твоем случае было его проявление.
В случае сомнений истинное количество найденных аккаунтом блоков можно прочитать непосредственно из блокчейна, минуя GUI, сделав запрос
или, если порт 7890 открыт, удаленно
где - ip любого полного узла (полный узел - узел с открытым портом 7890), который синхронизирован, своего или публичного.
Среди прочей информации будет количество найденных этим аккаунтом блоков, например:
... "harvestedBlocks":9, ...

     "после установки новой версии кошелька все пойманные ранее блоки исчезли"
Блокчейн только прирастает новыми блоками, уже имеющиеся записи не могут исчезнуть или измениться. Как и в первом случае, это чисто визуальный эффект, которому может быть одно из двух объяснений:

• это был этап синхронизации; пока блокчейн грузится, отображается вся история сети NEM, начиная с генезис блока. Найденные блоки будут отображаться когда они загрузятся.
• если же NIS синхронизирована, а найденные блоки не отображаются, значит мы находимся не в том аккаунте. Надо кликнуть по адресу текущего аккаунта (вверху слева), и в выпадающем списке выбрать нужный.