Ну про базу я образно, к примеру через rpc.
А клиент Bitcoin Core умеет работать только с базой на диске.
На то он и full-клиент.
Не делайте костыльные решения. Мало места - используйте SPV-клиента.
Чего вы боитесь-то?
Все равно такое решение когда-нибудь появится.
Тут вопрос в доверии, своему серверу я доверяю, Электруму не очень