Para minar litecoin necesitas el Guiminer scrypt, te lo puedes bajar de aquí https://bitcointalk.org/index.php?topic=150331.0

Este bastante bien configurado para novatos ya que hay una opción que te permite poner la configuración mas optima para tu tarjeta, ademas puedes usar el cgminer o el reaper.

Si tienes una ati 5xxx o 6xxx te recomiendo el cgminer si es una 7xxx te recomiendo el reaper.

Si usas el cgminer, únicamente apuntando al la dirección que te ha dado Miner2000 la de coinotron.com puerto 3334 ya estarías minando en stratum

Para el reaper tienes que usar la opción de proxy donde el proxy lo apuntas al coinotron.com 3334 y el reaper al localhost 8332