de que depende?
Del algoritmo y la arquitectura del hardware, hay algoritmos que funcionan mejor con la arquitectura AMD, y otros resultan más eficientes con arquitectura de Nvidia, depende de los métodos que se usan para paralelizar los cálculos, la electricidad que consumen y la memoria interna de cada "nucleo" de procesamiento... en fin, no soy experto en arquitectura de hardware, pero cada chip tiene sus detalles que la dan ventajas y desventajas para el procesamiento específico de cada algoritmo.