Hombre cuando montas risers de pciex, no es para dejarlas en la caja, te toca montar algo a ti y es lo mejor para separarlas y que respiren.
Si esa opción no te vale, monta refri líquida o ponle un cacharro de aire acondicionado soplándoles por el laeral, tb podría valer un ventilador de los de casa.
Tienes problemas de config? Lo digo por el puente crossfire, normalmente para minar lo recomendado es no ponerlo ni usar config cross.