Преимущество работы в штате - это общение в коллективе, ощущение "плеча". Ну, тут ещё и запись в трудовой имеет значение.
А фриланс хорош тем, что как раз никто не мешает, можно сосредоточенно выполнить необходимую работу, ещё и в любое удобное время.