Эхх, печалька... Как сделаю - покажу... IOREF зачем ?! если-бы не было этой цепочки задумано - IOREF-бы не требовался! А для цепочки - IOREF ставится на этот раз не VDD и не IOVDD/2, А _VDD/2_ - т.е. 0.3 V
Далее по нижней схеме - верхний резистор включен неправильно. Первый самый резистор в цепочке - "эталонный", от него выстраиваются все остальные напряжения (!). Еще один вариант - это собрать "эталонный" делитель напряжений на N чипов и использовать "reference" напряжение оттуда. Сейчас как раз этим занимаюсь!
Далее - с сигналами - резисторы однако надо добавлять и подтяжки! Например 200 Ом последовательно с OUTMOSI и потом на следующем через 200 Ом подтягивать к VDD. А с INMISO наоборот - тоже 200 Ом последовательно , а OUTMISO через 68 Ом на землю. Это для примера - и центры уровней станут на место. Резистор снаружи дешевле чем в чипе и ТОЧНЕЕ (ответ сразу на провокационный вопрос почему не сделал в чипе).