Ledger Nano Sは公式から購入できれば一番安いですが、在庫切れの状態で次の入荷は3月だそうです。
国内正規代理店ですが、Ledgerの公式ページに一覧があります。

日本の正規代理店一覧
https://www.ledgerwallet.com/retailers#japan

この一覧の中で、割高にはなりますが、まだ在庫がある代理店があります。

株式会社EARTH SHIP
https://hardwarewallet-japan.com/product/ledger-nano-s/

LANGREY INC.
https://myhardwarewallet.com/

BC TRANSPORT
https://shop.bctransport.tokyo/

一覧のリンクから調べた限り他の正規代理店は在庫切れのようでしたが見落としもあるかもしれませんので、
ご自身でも確認し納得してから購入してください。