Если обе биржи поддерживают монету, которую вы хотите перевести, то сделать это напрямую не составляет труда: на бирже, которую переводите, создайте кошелек для монеты (адрес), а на бирже, с которой отправляете - создайте транзакцию.

Иногда комиссия на вывод монеты очень велика (все зависит от биржи и комиссий сети монеты) - это стоит сразу узнать перед отправкой. Бывает выгодно обменять одну монету на другую (например BTC на LTC), отправить транзакцию, а уже потом произвести обратный обмен на бирже-получателе.