Habe mir auch schon überlegt was zu basteln wenn ich wirklich mit GPU's heizen würde 

Isolierung mit Styropor
So ein kleines Peltiermodul oder so + thermostat. Müste man mal testen und ausrechnen.
Ich denke man muss die ganze Heizung verkleiden damit es effektiv ist.

Von welchen Marken sind die Karten eigentlich?
Auf wieviel Khash kommst du pro Karte?