в README к оригинальному (самому оригинальному) bfgminer'у сказано, что если вы его сами компилировали, то лучше и запускать из той директории, где компилировали. Там и правда, по дороге строится пара библиотек, которые почему-то плохо устанавливаются через "make install". Я не стал разбираться с этим (просто лень), по этому запускаю из той папки, где и компилирую. Для автоматического запуска нужно будет подправить файл /etc/init.d/cgminer, в котором нужно прописать правильный путь к той версии cgminer/bfgminer, которую Вы хотите запускать.

Эдит: Если Вы мой форк пытаетесь запустить на тройном(двойном) устройстве, то согласно alpet'у нужно понизить чувствительность к вычисляемой частоте чипов. Мне проверить не на чем (у меня маленькое устройство)