Вы, как это часто бывает, путаете скорость и ускорение. Ускорение - да, бывает положительным и отрицательным, когда торможение.
Скорость, конечно, тоже можно условно назвать отрицательной, когда удаляешься от конечной точки. Но, поскольку, следуя первому закону Ньютона, все инерциальные системы равноправны, то скорость - это, в сущности, скаляр, а не вектор.