У той и той пробежки есть преимущества и неудобства.
- с утра больше энергии, особенно если натощак бегать. Если намерен сбросить вес, то с утра самое то. Вопрос в том что надо вставать хотяб в 5-6 часов. Плюс одной пробежкой не отделаться. Надо делать разминку интенсивную (не растяжку). Сам бег минимум 30 мин. + Заминка с физ нагрузко (турники, брусья). Мегатонна бодряка до обеда обеспечена, как и сон в обед.
- Вечером это все делается более размерено и на лайте. Время можно подбирать, какое удобней. Перед сном вообще огонь пробежаться. Менее комфортная обстановка. Шум, жара, дым, люди, собаки, машины, если в черте города. За город -  время на дорогу.
Кардинальных отличий нет. Однако.
Утром пробежка организмом воспринимается как бодрящая.
Вечером пробежка организмом воспринимается как расслабляющая.
Это при одинаковой интенсивности)
Вообщем такой личный опыт.