А почему хром блокирует скачивание.Пишет что программа может нанести вред вашему компьютеру.Ты там точно вирусов не на кидал.А если серъёзно что там не так.
Потому что оно в разрешении JAR(мультиплатформенность), хотя думаю на EXE он бы реагировал так же.