Где-то у вас баги похоже в коде. Bitcoind нормально работает с 10к адресами на тестовых нагрузках.
Доброго времени суток. Начинает падать когда много адресов в кошельке. Версия пока такая: с ростом хранимых адресов растет обмен данными с сетью и это провоцирует сбой. Т.е. если бы мы вешали ее запросами по RPC, то и с пустым wallet.dat проблема бы проявлялась, но ее там нет.