Во первых LN, это и есть участие третьей стороны. Во вторых, LN никакого отношения не имеет к бирже, если попытаться на основе LN построить биржу, то получится намного хуже чем waves dex. В третьих, как вы собираетесь хранить монеты одного блокчейна в другом блокчейне без участия третьей стороны? Это невозможно исходя из условия задачи. Другое дело, что можно попытаться распределить хранение активов между разными гарантами, но это очень сложно с точки зрения безопасности и доверия.
Ну и каша у вас в голове. LN имеет открытый исходный код. Средства хранятся на контракте, использующем скриптовый язык битка. У третьей стороны нет возможности увести средства, если в LN будут внедрены все запланированные фичи. Через LN биржа может быть построена на атомарных свопах, когда обмен производится при задействовании блокчейнов монет напрямую. Проблема возникает только при хранении заявок, непонятно как реализовать децентрализованный ордербук.
Но, тем не менее, биржа на LN - это третья сторона. Вот представьте теперь себе биржу, построенную на LN где к примеру 100000 пользователей. Теперь подумайте, каким образом атомарные свопы тут могут быть без участия третьей стороны. При каждом обмене тогда получается делать своп? Дак тут не только блокчейн битка не осилит, ни один не осилит такое количество транзакций. Если же не писать всё в блокчейн, так получим обычную централизованную биржу, опять же. Если даже как то удастся сделать биржу в виде децентрализованного графа, где не все со всеми будут создавать каналы, а допустим по 10 каналов на узел, тогда можно будет обмениваться обязательствами друг с другом через n-е число лиц, но если произойдёт какой то конфликт внутри такой сети, то блокчейн ляжет, после того как в него вывалят десятки тысяч транзакций разом. В любом случае будет нужна третья сторона с доверием. К тому же, чтобы добавить на такую биржу вечно зеленый бакс, либо любые другие реальные активы, все-равно будет нужна третья сторона. В итоге, я считаю, что децентрализованная биржа может быть только в едином блокчейне, примеров уже много. Но без реальных активов такая биржа настоящей не станет. А реальные активы - это присутствие третьей стороны.