Вот неплохая программа для хранения своих паролей, естественно с открытым исходным кодом!

Поддерживает все операционные системы...
Ну а если не хотите пользоваться подобным софтом, то могу порекомендовать придумывать сложные пароли и не дублировать их для разных сайтов!
Ну и еще по-меньше параноить!

Старый дедовский блокнот будет понадежнее любой программы даже и с открытым исходным кодом. Не нужно ни о чем переживать, все что надо - пишется в блокнот и блокнот сей в единственном варианте, без копий и прочего. За все годы что я так делаю никаких проблем никогда не было, но естественно и хранить его надо не на виду. Помню сильно хотел послать себе то-ли 1Password то-ли какую-то еще прогу такого плана известную, не поставил, а спустя год прочел о том что их вроде как скомпроментировали по-серьезному. Поэтому простота в этом случае она хоть и в ущерб удобству, но тише едешь - дальше будешь)