У меня очень низкомаржинальные сделки, в среднем 0.2-0.5% с пары. Там порядка тысячи сделок

Не думал попробовать использовать бота? С самым простецким алгоритмом, по типу бот проверяет стаканы на покупку и на продажу, смотрит дельту между ними, и если она выше некоторого значения (нужная прибыль + комиссия) - выставляет ордер на покупку и после покупки - сразу ордер на продажу.
Это если ты только лонгуешь, в шорт такой алгоритм не подойдет.