Если вы этого ещё не сделали, попробуйте увеличить количество пиров beacon-chain до 80:
--p2p-max-peers=80
Не факт, что поможет, но вдруг.
Очень похоже, что помогло. Причем эффект проявился не сразу, а только через день - другой. Периодически штрафы все же проскакивают, но, только на тех блоках, где мало голосов. Обычно голосов за блок больше тысячи, с этими все хорошо, но бывают блоки, где голосов всего 20, или, как в недавнем 170 - за такие и получаю штрафы.