bc1 - это native segwit, то есть "чистый" сегвит, а на 3 - тоже сегвит, так называемый nested segwit, то есть сегвит в старой "обертке", это сделано для совместимости с отставшими в развитии кошельками, биржами, обменниками и прочими сервисами (уточню насчет совместимости - с bc1 отправлять проблем нет никогда, некоторые сервисы отказываются отправлять на bc1-адреса.
Как я говорил, комиссии с адресов на bc1 процентов на 20-30 меньше, чем на тройку, но для некоторых совместимость в приоритете.

Я использую bc1 (есть у меня и на 3 для редких случаев несовместимости) и призываю всех использовать их тоже - это разгружает сеть.