Удивительные вещи вы рассказываете.
По моему опыту, все магазины, работающие с криптой, поддерживают биткоин. В даркнете основная валюта - монеро.
Подавляющее большинство магазинов работают через сервисы-посредники типа coinbase, которые поддерживают самые популярные валюты - штук пять, шесть обычно: BTC, LTC, DOGE, XMR, BCH...

Непонятно про какие комиссии речь. Магазин обычно выставляет цену в баксах, а просит оплатить криптой по курсу какой-нибудь биржи. Комиссию за отправку крипты в некоторых десктопных кошельках вы можете установить сами, но это делать не рекомендуется если нет достаточного опыта и знаний.

Сид фраза должна храниться только у вас в надежном месте, но так, чтобы вероятность потерять была минимальной. Я храню в запароленном архиве, а архив в облаке. Это не рекомендация, а пример просто если что ))