не будет ли проблем если у двух лиц, переводящих BTC один другому,
если у них разные ОС (ubuntu и windows xp например)?
Проблем быть не должно. Стандартный клиент изначально рассчитан на это.
и не будет ли проблем при переводе BTC через IP?
Перевод IP-to-IP возможно перехватить. Если между двумя компьютерами
окажется хакер, то он может подменить ответ принимающей стороны, что
может привести к тому, что биткоины будут отправлены на адрес хакера.