An der stelle wo du den Ordner entpackt hast den kompletten Pfad eingeben:

./bitcoin-0.9.1-linux/bin/32/bitcoin-qt

Du startet einfach die 9.1 Version. Wenn es funktioniert, dann solltest du alte 9.0 Version löschen.
Beide Versionen können parallel auf dem Rechner vorhanden sein.
Der Unterschied ist, die Ubuntu-Pakete Dateien in die entsprechenden Systemordner kopiert.