Скажите, в PebbleDB есть аналог ancient?
Ancient остаётся тот же самый, что и для LevelDB. Именно поэтому разработчики разрешают его не удалять при миграции LevelDB -> PebbleDB.
И какой размер базы в итоге получился?
800 ГБ. Это размер всей базы вместе с ancient.