Que eu saiba, carteiras de 1 ou 2 seeds não são compatíveis com BIP 39. Os formatos seriam 3-6-9-12-15-18-21-24 palavras.
Tem que ir em "I already have a seed" e marcar a opção de "bip39".. aceita qualquer coisa mesmo mostrando que a lista é desconhecida:

Não sei se pode ser considerado uma vulnerabilidade.. já que alguém pode gerar uma carteira fraca.. mas pelo menos da pra importar quaisquer seeds fora dos padrões da Electrum/BIP39, o que também é bom.