он прямиком на 12В по входу подключен, так что бесполезно.
Как вариант, можно пустить + кулера через 1-2 диода, смотря на сколько надо опустить обороты. Это самое простое решение.
Кстатитам еще есть CN103 или CN3 незадействованный... просто заметил, но не разбирался что к чему, возможно это для кулера с таходатчиком. (нет схемы под рукой)