Pues parece que el saldo es correcto en el blockchain explorer.
En su día confirmé las transacciones y la última vez que me metí en mi maletín el saldo era el correcto.

Parece que hay un fallo al mostrar el balance y por lo que veo no soy el único al que le ha pasado:
https://nxtforum.org/mynxt-info/funds-completely-disappeared/

Vaya gracia que después de lo de Gox, entres en tu wallet para ver si tus nxt´s al menos siguen ahí y te encuentres con que parece que te los han limpiado también