Перенос биткоинов между разными операционными системами методом копирования или
перемещения wallet.dat не рекомендуется, так как версия Berkeley DB может отличаться.
Безопасным вариантом является простая отправка биткоинов с одного адреса на другой.
Запросите биткоин-адрес клиента под Ubuntu и отправьте на этот адрес из под Windows.