beh siccome i sistemi linux e freebsd sono piuttosto simili, mi sarebbe piaciuto capire in base a cosa mi dà unsupported operating system, in quanto probabilmente senza quel controllo funziona ugualmente :-)
La libusb che trovi in cgminer e' custom, quindi sarebbe inutile provare a compilare con quella stock di sistema.. se guardi in configure:11843 e in cgminer/compat/libusb-1.0/libusb/os puoi vedere che manca freebsd fra le implementazioni os-specific.