... а вендузятники просто обновят саму программу.
Так и есть 
Наступите себе на горло и держите одну машину на Windows. На этой версии сборка под Linux полезна наличием какой-то мегабиблиотеки. Ее название мне не удалось перевести - не специалист в предметной области. Из-за библиотеки обещана более быстрая генерация на некоторых процессорах. Если такого железа нет, то и с Linux возиться нет смысла. В этом комментарии ты дважды (а может и больше) делишь на ноль.
SSE2 есть во всех пнеобразных процессорах начиная примерно с 3. С линукс есть смысл возиться потому что у меня, например, это основная и единственная ОС, как и у многих моих коллег.