Até onde sei a versão oficial não permite fazer multiplas wallets, nem informar um outro arquivo na linha de comando.
Existe uma versão alternativa no git que faz isso, mas a quatro meses não havia previsão de entrar no core.
Realmente não sei como poderia ser feito.
O recurso "account" no RPC serve apenas para agrupar recebimentos, mas não serve para ver saldos.
Se usarmos o parâmetro -datadir podemos "emular" essa funcionalidade de usar vários wallets.dat, obviamente não é algo elegante a se fazer, mas funciona
O Curioso é que se você der um "getbalance" sem parâmetro algum ele retorna o seu saldo total direitinho, o problema é quando você dá um "getbalance" para cada conta que você tem cadastrada, neste caso ele retorna números que não fazem sentido algum.