O problema com o "account" é que quando vc envia BTC não consegue especificar um account, então ele tira saldo de qualquer um e de varios ao mesmo tempo, bagunçando o saldo.
A sua ideia de fazer varias pastas data vai criar um problema: copias do blockchain.
Com linux vc poderia fazer alguns links de uma pasta comum onde estaria o blockchain, mas vai ficando uma gambiarra difici de manter.
Talvez você queira experimentar com a versão alternativa do CodeShark comentada em
https://github.com/bitcoin/bitcoin/pull/2124Eu nunca usei então não sei avaliar a maturidade desse branch.
Mas por qual motivo se eu olhar o saldo total ele consegue calcular adequadamente ?, dependendo de como os saldos foram movimentados, se você consultar as contas separadamente ele retorna saldos que a somatória dá umas 3 vezes o saldo real, isto no meu ponto de vista é um Bug.
Sobre as varias pastas, tem razão, talvez então o mais adequado seja carregar sempre no mesmo diretório mas manipular o arquivo wallet.dat, sempre sobrescrevendo com o arquivo da carteira que você quer manipular.
Vou dar uma olhada nessa versão alternativa do CodeShark