Bitcoin Core не поддерживает BIP39, поэтому в процессе генерации мастер-ключа (xprv) из сида мнемоническая фраза не участвует:
На мой взгляд, это огромнейший минус Bitcoin Core.
один из разработчиков объясняет, почему не внедряется BIP39 в Bitcoin Core. Вкратце, во-первых, многие разработчики считают PBKDF2 недостаточно безопасным, а во вторых по тем же причинам, почему разработчики Electrum отказались от BIP39 - привязанность к фиксированному словарю и отсутствие версий.