Читал, что по возможности всегда лучше через pip ставить все питоновские приложения, так как pip всегда правильно устанавливает зависимости и исключает возможности ошибок. А вот AppImage в некоторых ситуациях так то может и тупить.
Интересно. Мне кажется логичным как раз наоборот - в AppImage все нужные для работы библиотеки по идее включены, к тому же все файлы протестированы и подписаны разработчиком Электрума. Ну и плюсом считаю, что не раскидываются файлы по системе, все в одном месте.