Acho que tem um risco não-zero, sim. Provavelmente é uma boa manter backups separados em outro driver, e ai você fica repondo ele com o tempo. Lembrando que até seu HD pode corromper de uma hora pra outra. Aqui ainda não tive esse azar.

Sim, corrompe os arquivos se você forçar encerrar ou desconectar a unidade/container criptografado de forma incorreta. Uma vez eu abri uma planilha, estava escrevendo ela, sei lá, um artigo com dados, bati no pendrive(sem desconectar), quando tentei usar a planilha novamente, ela simplesmente criou 900 páginas em mais de 100 tipos de caracteres, tipo chinês, japonês ou grego. Perdi todo o artigo, porque mesmo acessando corretamente, a ferramenta fez o que foi proposta a fazer, corrompeu o arquivo enquanto estava desprotegido(contêiner montado = sem criptografia). Não sei se isso se aplica hoje em dia, mas no meu teste deu isso.